中国科学院南京地质古生物研究所成立于1951年，李四光先生任第一任所长。建所以来先后有14位科学家当选为中国科学院院士，目前拥有中科院院士3人。是我国唯一从事古无脊椎动物学和古植物学研究的国家级专业机构，被国际同行誉为“世界三大古生物学研究中心之一”。在早期生命起源和寒武纪大爆发，重大地史时期生物的辐射、灭绝与复苏，全球界线层型“金钉子”等领域获得了一系列国际著名的研究成果，“澄江动物群与寒武纪大爆发”曾获2003年度国家自然科学奖一等奖。拥有科普场馆“南京古生物博物馆”，年均接待游客10万余人，组织达尔文大讲堂、博物馆科学营、科普创作大赛、全国化石爱好大会、科普进校园等系列科普活动。主办科普杂志《生物进化》， 编著出版系列科普图书，《远古的悸动—— 生命起源与进化》曾获2014年度国家科技进步奖二等奖。主办科普网站《化石网》，曾获得联合国2009年“世界信息社会峰会大奖”(WSA)。